5 NILAI BUDAYA KERJA KEMENTERIAN AGAMA. 1. INTEGRITAS. 2. PROFESIONALITAS. 3. INOVASI. 4. TANGGUNG JAWAB. 5. KETELADANAN. PELAKSANAAN PTS 2017/2018 TANGGAL 25 SEPTEMBER S/D 2 OKTOBER 2017. Senin, 25 Sept 2017 Bahasa Indonesia dan Qur'an Hadis. Selasa, 26 Sept 2017 Matematika dan Akidah Ahlak. Rabu, 27 Sept 2017 Bahasa Inggris dan Fiqih. Kamis, 28 Sept 2017 IPA dan SKI. Jum'at, 29 Sept 2017 Seni Budaya. Sabtu, 30 Sept 2017 Bahasa Arab dan PKn. Senin, 2 Okt 2017 IPS dan Bahasa Jawa.
Kurikulum
Kurikulum  MTs Negeri 1 Kudus menerapkan  Kurikulum Kementerian Pendidikan Nasional  yang dipadukan dengan Kurikulum Kementerian Agama dan dikembangkan sesuai dengan visi, misi dan tujuan  MTs Negeri 1 Kudus. Dengan demikian, peserta didik  MTs Negeri 1 Kudus  akan mendapatkan pendidikan serta pelajaran  umum seperti peserta didik di sekolah umum (Kemendiknas) dan pendidikan agama seperti  peserta didik di  madrasah (Kemenag).

MTs Negeri 1 Kudus juga menerapkan  program-program dan penanaman nilai-nilai keagaman serta ketrampilan kepada peserta didik  antara lain melalui : tadarus Al Qur’an,  membaca doa dan Asmaul husna pada awal jam pembelajaran, sholat dhuha, sholat dhuhur berjamaah, , pembiasaan mengucapkan salam, ketrampilan khitobah dan praktik-praktik ibadah lainnya.
Selain itu MTs Negeri 1 Kudus  juga menyelenggarakan beberapa jenis kegiatan ekstrakuriler yang dapat digunakan untuk mengembangkan bakat dan minat peserta didik.

Dengan memadukan kedua kurikulum tersebut dan pengembangan  kurikulum madrasah serta program-program madrasah, maka diharapkan akan terwujud insan-insan yang cerdas, trampil, berakhlakul karimah dan memiliki budi pekerti serta kepribadian yang kuat.